Аудан тарихындағы медицинаның алғашқы беттері 1916 жылдан басталады. Ол кезде Степановка (қазіргі Үшарал) ауылына алғашқы медициналық қызметкер келген болатын. Алғашқы медпункт ауылдағы дәулетті адамдардың үйінде орналасып, халыққа қарапайым көмек көрсете бастады. Кейінірек, Кеңес өкіметінің алғашқы жылдарында ауданға В.Г. Кашлаков пен С. Сендюков есімді фельдшерлер келіп, жүйелі жұмыстың негізін қалады. 1930 жылы Үшаралда 10 төсектік алғашқы аурухана ашылып, сонымен қатар алғашқы дәріхана өз жұмысын бастады.
Қалыптасу кезеңі: Желінің кеңеюі (1936–1960 жж.)
1930-1940 жылдары ауылдық жерлерде медицина қарқынды дамыды. 1936 жылы Андреевка (қазіргі Қабанбай) ауылында аудандық аурухана ашылды. 1937-1943 жылдар аралығында Көктұма, Қамысқала, Обуховка және Еңбекші ауылдарында жаңа фельдшерлік пункттер бой көтерді. Соғыстан кейінгі жылдары, атап айтқанда 1950 жылы, ауданда 4 аурухана, 4 фельдшерлік пункт, 1 орталық дәріхана және безгекке қарсы станция жұмыс істеп тұрды. 1960 жылы Үшаралда туберкулезге қарсы диспансердің ашылуы өңірдегі санитарлық жағдайды жақсартуға үлкен үлес қосты.
Даму және жаңғыру (1970–2010 жж.)
1970-1980 жылдар аурухана үшін инфрақұрылымның алтын дәуірі болды. 1971 жылы Үшаралда 100 орындық типтік аудандық аурухана салынса, 1982 жылы ауысымына 300 адамды қабылдай алатын жаңа емхана пайдалануға берілді. Тәуелсіздік алғаннан кейін де медициналық желі кеңейе берді: 1992 жылы Достық станциясында 15 орындық аурухана ашылып, 2010 жылы ол 50 орындық заманауи кешенге айналды.
Қазіргі заман (2011 жылдан бүгінге дейін)
2011 жылы 1 желтоқсанда мекеме «Алакөл аудандық орталық ауруханасы» ретінде қайта ұйымдастырылып, шаруашылық жүргізу құқығындағы мемлекеттік коммуналдық кәсіпорын мәртебесін алды. 2019 жылы Қабанбай ауылдық ауруханасы ЦРБ құрамына бөлімше болып қосылды.
Бүгінде Алакөл ЦРБ — құрамында хирургия, реанимация, терапия, балалар бөлімі және перзентханасы бар, 120-дан астам білікті дәрігер мен 500-ден астам орта буын мамандары еңбек ететін ірі медициналық орталық. Аурухана тек емдеумен ғана шектелмей, ең шалғай ауылдарға дейін медициналық көмек жеткізетін, тарихы терең, болашағы жарқын мекемеге айналды.